Negli ultimi mesi, la produzione di colture geneticamente modificate è stata una delle questioni politiche maggiormente discusse in ambito europeo. Coloro che protestano contro l'uso delle biotecnologie hanno organizzato una campagna molto negativa che al momento sembra espandersi verso altri paesi del mondo.
A causa dello sviluppo di questa campagna negativa, i consumatori ed i rivenditori al dettaglio si trovano in una posizione decisamente contraria all'uso delle colture geneticamente modificate. Data questa reazione negativa, molti agricoltori europei preferirebbero non utilizzare colture transgeniche.
Il CEJA riconosce i potenziali benefici delle colture geneticamente modificate in termini di produttività e di riduzione nell'uso dei pesticidi, e deve assicurarsi di condurre il dibattito per permettere al pubblico di essere consapevole dei fatti, in modo che questo possa prendere decisioni informate.
I giovani agricoltori dell'UE sottolineano inoltre:

• Ricerca - La necessità di una ricerca continua nel campo delle colture transgeniche. Una ricerca indipendente, che guardi in modo specifico alla sicurezza degli alimenti ed alla sicurezza ambientale, dovrebbe essere considerata prioritaria.
  
• Uso delle colture geneticamente modificate - La ricerca effettuata dovrebbe considerare che tutte le colture geneticamente modificate assicurino la salute e la sicurezza degli alimenti, la protezione del paesaggio e la diversità biologica.
  
• Scelta per il consumatore - I consumatori devono sempre poter scegliere tra prodotti geneticamente modificati e prodotti non geneticamente modificati. Per assicurare questa scelta, è essenziale un sistema chiaro di etichettatura per informare meglio il consumatore.